New concepts may prove necessary to profit from the avalanche of sequence data on the genome, transcriptome, proteome and interactome and to relate this information to cell physiology. Here, we focus on the concept of large activity-based structures, or hyperstructures, in which a variety of types of molecules are brought together to perform a function. We review the evidence for the existence of hyperstructures responsible for the initiation of DNA replication, the sequestration of newly replicated origins of replication, cell division (...) and for metabolism. The processes responsible for hyperstructure formation include changes in enzyme affinities due to metabolite-induction, lipid-protein affinities, elevated local concentrations of proteins and their binding sites on DNA and RNA, and transertion. Experimental techniques exist that can be used to study hyperstructures and we review some of the ones less familiar to biologists. Finally, we speculate on how a variety of in silico approaches involving cellular automata and multi-agent systems could be combined to develop new concepts in the form of an Integrated cell (I-cell) which would undergo selection for growth and survival in a world of artificial microbiology. (shrink)

Cet ouvrage est une réédition numérique d’un livre paru au XXe siècle, désormais indisponible dans son format d’origine.

When it was first published in French in 1980, The Ordinary Man of Cinema signaled a shift from the French film criticism of the 1960s to a new breed of film philosophy that disregarded the semiotics and post-structuralism of the preceding decades. Schefer describes the schizophrenic subjectivity the cinema offers us: the film as a work projected without memory, viewed by (and thereby lived by) a subject scarred and shaped by memory. The Ordinary Man of Cinema delineates the phenomenology of (...) movie-going and the fleeting, impalpable zone in which an individuals personal memory confronts the cinemas ideological images to create a new way of thinking. It is also a book replete with mummies and vampires, tyrants and prostitutes, murderers and freaksfigures that are fundamental to Schefers conception of the cinema, because the worlds that cinema traverses (our worlds, interior and exterior) are worlds of pain, unconscious desire, decay, repressed violence, and the endless mystery of the body. Fear and pleasure breed monsters, and such are what Schefers emblematic "ordinary man" seeks and encounters when engaging in the disordering of the ordinary that the movie theater offers him. Among other things, Schefer considers "The Gods" in 31 brief essays on film stills and "The Criminal Life" with reflections on spectatorship and autobiography. While Schefers book has long been standard reading in French film scholarship, until now it has been something of a missing link to the field (and more broadly, French theory) in English. It is one of the building blocks of more widely known and read translations of Gilles Deleuze (who cited this book as an influence on his own cinema books) and Jacques Rancière. (shrink)

Signifiance du monde propose une "harmonisation intégrale" entre la linguistique saussuro-guillaumienne des langues naturelles et la pensée phénoménologique heideggérienne de la vérité de l'être en tant qu'alètheia, dans son sens grec de "ce qui sort de la latence" et que Jean-Louis Tristani nomme illatence. En d'autres termes, cet essai donne accès à une compréhension des "relations grammaticales évidentes qui articulent l'être, dans sa vérité, et la pensée, telles qu'elles sont a priori données dans le système linguistique de n'importe (...) quelle langue naturelle". Cette mise au jour de la co-originarité de la langue et de la pensée corrobore la formule du linguiste français Antoine Meillet, maintes fois citée par Gustave Guillaume, selon laquelle, en ce lieu intelligible de la langue "tout se tient et a un plan d'une pleine rigueur". Une rigueur qui intègre le système morpho-lexical d'une langue, en tant qu'intégrale des conditions d'effection du discours, avec les conditions existentiales de possibilité du Dasein en tant qu'être-au-monde. D'où Signifiance du monde, ce titre qui annonce la composante linguistique de notre présence au monde."--Page 4 of cover. (shrink)

Inλ-calculus, the strategy of leftmost reduction (“call-by-name”) is known to have good mathematical properties; in particular, it always terminates when applied to a normalizable term. On the other hand, with this strategy, the argument of a function is re-evaluated at each time it is used.To avoid this drawback, we define the notion of “storage operator”, for each data type. IfT is a storage operator for integers, for example, let us replace the evaluation, by leftmost reduction, ofϕτ (whereτ is an integer, (...) andϕ anyλ-term) by the evaluation oftτϕ. Then, this computation is the same as the following: first computeτ up to some reduced formτ 0, and then applyϕ toτ 0. So, we have simulated “call-by-value” evaluation within the strategy of leftmost reduction.The main theorem of the paper (Corollary of Theorem 4.1) shows that, in a second orderλ-calculus, using Gödel's translation of classical intuitionistic logic, we can find a very simple type (or specification) for storage operators. Thus, it gives a way to get such operators, which is to prove this type in second order intuitionistic predicate calculus. (shrink)

Aristote soutenant que les plaisirs corporels se sont accaparés le nom de plaisir, il sous-entend clairement par là que ce ne sont pas les seuls. On aurait tort, cependant, malgré la tradition médiévale, de ne voir dans les plaisirs non-corporels que les plaisirs dus à la « vie contemplative » menée par le sage d’Aristote. Il existe des « plaisirs intellectuels » et ils ne sont pas nécessairement « spirituels ». C’est par exemple le cas du géomètre exerçant la géométrie (...) et c’est à l’analyse de ces plaisirs qu’est consacrée cette étude. (shrink)

Véronique Adam : Les neurosciences ne s’intéressent que depuis très récemment à l’olfaction. Pourriez‑vous expliquer pourquoi ce sens est devenu un objet d’étude plus prégnant? Jean-Louis Millot : En fait, l’olfaction demeure encore peu étudiée comparée à d’autres modalités sensorielles. De manière générale, les neurosciences cognitives actuelles, comme d’autres investigations scientifiques chez l’homme par le passé, se focalisent davantage sur les compétences cognitives complexes, telles qu...

Reflecting Alan Robinson's fundamental contribution to computational logic, this book brings together seminal papers in inference, equality theories, and logic programming. It is an exceptional collection that ranges from surveys of major areas to new results in more specialized topics. Alan Robinson is currently the University Professor at Syracuse University. Jean-Louis Lassez is a Research Scientist at the IBM Thomas J. Watson Research Center. Gordon Plotkin is Professor of Computer Science at the University of Edinburgh. Contents: Inference. Subsumption, (...) A Sometimes Undervalued Procedure, Larry Wos, Ross Overbeek, and Ewing Lusk. The Markgraf Karl Refutation Procedure, Hans Jurgen Ohlbach and Jorg H. Siekmann. Modal Logic Should Say More than it Does, Melvin Fitting. Interactive Proof Presentation, W. W. Bledsoe. Intelligent Backtracking Revisited, Maurice Bruynooghe. A Science of Reasoning, Alan Bundy. Inductive Inference of Theories from Facts, Ehud Y. Shapiro. Equality. Solving Equations in Abstract Algebras: A Rule-based Survey of Unification, Jean-Pierre Jouannaud and Claude Kirchner. Disunification: A Survey, Hubert Comon. A Case Study of the Completion Procedure: Proving Ring Commutativity Problems, Deepak Kapur and Hantao Zhang. Computations in Regular Rewriting Systems I and II, Girard Huet and JeanJacques Levy. Unification and ML Type Reconstruction, Paris Kanellakis, Harry Mairson, and John Mitchell. Automatic Dimensional Analysis, Mitchell Wand. Logic Programming. Logic Programming Schemes and Their Implementations, Keith Clark. A Near-Horn Prolog for Compilation, Donald Loveland and David Reed. Unfold/Fold Transformations of Logic Programs, P. A. Gardner and J. C. Shepherdson. An Algebraic Representation of Logic Program Computations, Andrea Corradini and Ugo Montanari. Theory of Disjunctive Logic Programs, Jack Minker, Arcot Rajasekar, and Jorge Lobo. Bottom-Up Evaluation of Logic Programs, Jeffrey Naughton and Raghu Ramakrishnan. Absys, the First Logic Programming Language: A View of the Inevitability of Logic Programming, E. W. Elcock. (shrink)

Les traites de zoologie d'Aristote ne sont nullement des traites mineurs, voire anecdotiques, mais des traites a inscrire au contraire dans la vaste enquete sur la nature qu'il entendait mener et qui caracterise si bien sa philosophie. Qu'en est-il cependant des capacites animales telles qu'Aristote les a decrites? Le probleme est autre, tant dans nombre de recherches recentes, les animaux eux-memes semblent avoir ete parfois comme oublies en chemin au profit de recherches plus epistemologiques. C'est ce singulier oubli que ces (...) etudes voudraient commencer de reparer en s'attachant a ce qu'Aristote dit effectivement de la vie meme des animaux et de leurs capacites a communiquer, a vivre en societe, voire tout simplement a se mouvoir. Qu'en est-il exactement de la difference entre la voix que possedent certains animaux et le langage propre aux etres humains? Comment se peut-il qu'Aristote qualifie certains autres animaux que l'homme de politiques et non seulement de gregaires? Par quels mecanismes psychologiques et physiologiques les animaux se mettent-ils en mouvement? Que cherche a expliquer le pretendu syllogisme pratique? Telles sont les questions abordees dans ces etudes. (shrink)

Le problème de la vérité a toujours préoccupé l'esprit humain; il hante pour ainsi dire l'homme d'aujourd'hui. Dans les brèves réflexions qui vont suivre, nous nous proposons de présenter une approximation tres limitée de ce problème tel qu'il se pose à la philosophic traditionnelle, à savoir: Le caractère historique et relatifde la connaissance humaine est-il conciliable avec I'affirmation de vérites immuables?

Cet article étudie ce que l’on peut entendre par « ce qui dépend de nous » dans la tradition aristotélicienne. L’auteur interroge les tenants de l’apparition d’un Self chez les Stoïciens et remet vivement en question certaines conceptions de l’histoire de la philosophie. Il soutient qu’il n’y a pas de raison, et même moins, de voir en Épictète l’inventeur du « libre arbitre », pas plus qu’il n’y en a de voir chez les Stoïciens une quelconque naissance de la subjectivité (...) en raison de l’innovation qu’aurait été la notion d’assentiment. L’argumentation repose sur la conception « libertarienne » du « ce qui dépend de nous » par Alexandre d’Aphrodise.De « ce qui dépend de nous »This paper examines that what is the meaning of « what depends on us » in the Aristotelian tradition. The Author adresses all those who think that the Self was originated by the Stoics. He criticizes in a provocative way some manners in the history of philosophy. He champions that there is no cause, or even less, to understand Epictetus as any creator of the liberum arbitrium, no more than to understand the Stoics as the origine of our modern conception of the subjectivity because of their notion of assent. The argument rests on the « libertarian » conception of « what depends on us » by Alexander of Aphrodisias. (shrink)

Plutôt que de prendre le parti d’une critique – par ailleurs légitime – des usages, notamment managériaux, de la compétence éthique, ce texte propose de prendre le concept au sérieux et de tenter de l’éclairer en s’appuyant notamment sur les approches pragmatistes des émotions développées par James, Dewey et Peirce. Plutôt que de privilégier une accentuation délibérative et argumentative des compétences éthiques favorisée par l’efflorescence et la multiplication des « comités d’éthique », il cherche principalement à penser les émotions comme (...) compétences éthiques, tout en en revendiquant une conception cognitiviste. Les « compétences éthiques » sont tout d’abord déployées sous les accentuations possibles de la responsabilité, distinguées selon la grammaire des pronoms personnels, comme autonomie, comme sollicitude, comme souci du collectif, comme accusation... L’éclairage pragmatiste des émotions comme compétences éthiques permet ensuite d’ouvrir à une approche renouvelée de l’« engagement » pensé comme compétence, couvrant un large spectre allant des engagements volontaires, obéissant à des décisions, jusqu’à des engagements à dominante émotionnelle caractéristiques par exemple des « communautés esthétiques », du ressentir, du vibrer ensemble. (shrink)

Introduction. Il est bien connu que la correspondance de Curry-Howard permet d'associer un programme, sous la forme d'un λ-terme, à toute preuve intuitionniste, formalisée dans le calcul des prédicats du second ordre. Cette correspondance a été étendue, assez récemment, à la logique classique moyennant une extension convenable du λ-calcul. Chaque théorème formalisé en logique du second ordre correspond donc à une spécification de programme.Il se pose alors le problème, en général tout à fait non trivial, de trouver la spécification associée (...) à un théorème donné; autrement dit, de déterminer le comportement opérationnel commun aux λ-termes associés aux diverses démonstrations formelles du théorème considéré.Cette question est résolue ici pour le théorème de complétude de la logique classique.La première étape consiste à formaliser convenablement ce théorème en logique du second ordre. Ce travail est fait complètement dans la section 1. Il a comme sous-produit, peut-être inattendu, de montrer que ce théorème est prouvable en logique intuitionniste du second ordre. Ceci, toutefois, à condition d'introduire une légère variante de la notion de modèle, en admettant un modèle supplémentaire trivial, où toute formule est satisfaite.On notera, à ce sujet, que des preuves intuitionnistes du théorème de complétude de la logique intuitionniste, utilisant des variantes de la notion de modele de Kripke, ont été données par H. Friedman [7] et W. Veldman [8]. On remarquera également qu'un argument de G. Kreisel [2] montre que le théorème de complétude habituel de la logique intuitionniste n'a pas de preuve intuitionniste. (shrink)

La défense canguilhemienne de l’institution philosophique s’inscrit dans une lignée républicaine ; cette attitude diffère de celle propre à certains de ses contemporains (Nizan), ou de ses cadets (Althusser, Foucault). Canguilhem a toujours défendu l’importance de la philosophie quand elle était menacée par les sciences humaines et sociales, tant au moment du succès de l’existentialisme que pendant le structuralisme des années 1960 ; il fut, en même temps, le critique de certaines manières de concevoir la philosophie (existentialiste ou spiritualiste), de (...) certaines modes de sa pratique (journalistique ou littéraire), et un innovateur en matière de pédagogie. (shrink)

, which uses the intuitionistic propositional calculus, with the only connective →. It is very important, because the well known Curry-Howard correspondence between proofs and programs was originally discovered with it, and because it enjoys the normalization property: every typed term is strongly normalizable. It was extended to second order intuitionistic logic, in 1970, by J.-Y. Girard [4], under the name of system F, still with the normalization property.More recently, in 1990, the Curry-Howard correspondence was extended to classical logic, following (...) Felleisen and Griffin [6] who discovered that the law of Peirce corresponds to control instructions in functional programming languages. It is interesting to notice that, as early as 1972, Clint and Hoare [1] had made an analogous remark for the law of excluded middle and controlled jump instructions in imperative languages.There are now many type systems which are based on classical logic; among the best known are the system LC of J.-Y. Girard [5] and the λμ-calculus of M. Parigot [11]. We shall use below a system closely related to the latter, called the λ c -calculus [8, 9]. Both systems use classical second order logic and have the normalization property.In the sequel, we shall extend the λ c -calculus to the Zermelo-Frænkel set theory. The main problem is due to the axiom of extensionality. To overcome this difficulty, we first give the axioms of ZF in a suitable (equivalent) form, which we call ZF ɛ. (shrink)

Deep learning and other similar machine learning techniques have a huge advantage over other AI methods: they do function when applied to real-world data, ideally from scratch, without human intervention. However, they have several shortcomings that mere quantitative progress is unlikely to overcome. The paper analyses these shortcomings as resulting from the type of compression achieved by these techniques, which is limited to statistical compression. Two directions for qualitative improvement, inspired by comparison with cognitive processes, are proposed here, in the (...) form of two mechanisms: complexity drop and contrast. These mechanisms are supposed to operate dynamically and not through pre-processing as in neural networks. Their introduction may bring the functioning of AI away from mere reflex and closer to reflection. (shrink)

Two strains of male mice have bred over fortygenerations, starting with the work of RobertCairns and his colleagues, one strain with ahigh level of intra-species aggression, theother a low level of aggression. Thehigh-aggression mice tend to establishdominance hierarchies and particularly fight inthe presence of female mice. Thelow-aggression mice tend, in groups of theirown, to have a high degree of low-intensity,peaceful social contact, and to be more timidin initiating action than the high-aggressionmice. Biochemical differences have beenobserved between the two strains, and (...) confirmedby the present data: the high-aggression micehave greater dopamine concentrations (in thecaudate nucleus and nucleus accumbens), lowerlevels of the stress hormone corticosterone,and higher levels of testosterone than thelow-aggression mice. The current experimentswere designed to answer questions about theflexibility of adaptive behaviors:specifically, what is the effect of early dailymaternal separation on adult stress response ineach strain? What are the behavioral andhormonal mechanisms by which, as has beenobserved, low-aggression mice achieve adominant status when brought into situationswhere they compete for territory withhigh-aggression mice? Finally, what are thesocial and neurochemical mechanisms by whichhigh-aggression mice can develop low-aggressionbehavior if brought out of isolation and intogroups?Maternal separation was found to lead todecreases in stress levels, as measured bycorticosterone, in the low-aggression but notthe high-aggression, mice – presumably becauseof the surplus of maternal care the pupsreceive on returning to the nest. When alow-aggression mouse became dominant and ahigh-aggression mouse became submissive, theirusual pattern of corticosterone andtestosterone levels was found to be reversed. The change to low-aggression behavior inhigh-aggression mice switching from anisolation condition to a group condition, wasmediated by a decrease in D 1 dopaminereceptor densities.These results, like the ones on which theybuild, argue for substantial developmentalinfluences in expressions of the genesinfluencing aggressive or cooperative behavior. In this approach to evolution, epigenesis istreated not as a set of traits and behaviorspredetermined by the genome, but as a set ofprobabilistic tendencies toward certain traitsand behaviors. (shrink)

De Nous n’avons jamais été modernes jusqu’à l’Enquête sur les modes d’existence, Latour s’est toujours positionné sur le terrain de l’anthropologie, articulant une anthropologie comme méthode d’enquête avec une anthropologie comme objet de l’enquête. Rappelant les thèses de Foucault qui décrivent l’homme de la modernité comme « doublet empirico-transcendantal », et s’appuyant sur une lecture de Kant qui privilégie l’antinomie liberté-déterminisme, cet article montre que la modernité est passée d’une dominante anthropologique disjonctive séparant les êtres à une dominante conjonctive dans (...) laquelle ils se situent sur un continuum allant de l’hétéronomie à l’autonomie, où nature et culture s’entrelacent…. Loin de rompre avec la modernité, la pensée de Latour serait on ne peut plus moderne, radicalisant le passage de la disjonction vers la conjonction, mais s’empêtrant dans les antinomies de sa propre radicalité.Beginning with We Have Never Been Modern up to An Inquiry into Modes of Existence, Latour has always positioned himself in the field of anthropology, articulating anthropology both as a method of inquiry and as the object of inquiry. Through recourse to Foucault's claim that modernity’s human is an “empiricaltranscendantal doublet”, and based on a reading of Kant that champions the freedom-determinism antinomy, this article shows that modernity has shifted from a “disjunctive” anthropological trend that separates beings into a conjunctive trend that locates them on a continuum going from heteronomy to autonomy, where nature and culture intertwine…. Far from breaking with modernity, Latour’s thinking could not be more modern, since it radicalizes the shift from disjunction to conjunction, though at the cost of tangling up in the antinomies of its own radicalism. (shrink)

Ce texte a déjà paru dans la revue EspacesTemps le 30/05/2019. Résumé : À bien des égards, les politiques mais aussi les pratiques de la ville connaissent aujourd'hui ce que l'on pourrait appeler un « tournant esthétique ». La plupart du temps, ce tournant fait l'objet d'analyses centrées sur l'une ou l'autre de ses composantes, comme par exemple la montée des référentiels de la ville créative ou de l'attractivité, mais sans que ne soit pleinement réfléchie leur portée esthétique, au sens (...) plein du terme, - Urbanisme – Nouvel article. (shrink)

Jean-Louis Fournel, abordant la période des guerres d’Italie, tente de montrer comment ces nouvelles guerres modifient l’intensité et le rythme de la guerre guerroyée : la conscience d’une violence et d’une rapidité inédites fait planer une menace de mort sur les États eux-mêmes et la question de la guerre est dès lors placée au cœur de la pensée politique. Trois manifestations de ces « nouvelles » guerres marquent particulièrement les contemporains et autorisent l’analyste à évoquer ici une « (...) brutalisation » ou un ensauvagement des conflits, bien avant la Première Guerre mondiale qui a fondé récemment le développement d’une telle problématique : les sacs de ville, la mise en coupe réglée des territoires conquis avec le développement d’une véritable guerre contre les civils et, enfin, l’augmentation exponentielle du nombre de morts durant les batailles (du fait entre autres des modifications dans l’armement et du nombre de soldats constituant les nouvelles armées « nationales »). S’ensuivent des tentatives d’une nouvelle « humanisation », très relative des conflits armés fondée sur un nouvel examen du jus in bello (par opposition à une quasi disparition de la question du jus ad bellum). Il est notable à cet égard que le lexique de la « barbarie » est très peu utilisé chez les chroniqueurs et historiens des guerres d’Italie alors même qu’il a une forte présence chez les historiens et témoins des guerres de Religion en France. On peut se poser la question de savoir s’il ne faudrait pas voir là une certaine « rechristianisation » du discours sur la guerre. De la sorte, cette « rechristianisation » d’une partie de la réflexion sur la violence de guerre, au croisement du déclin de l’idéologie chevaleresque, des réflexions philosophiques, théologiques ou juridiques nées des massacres commis par les conquistadores dans le « nouveau monde » (Cortez avait fait ses premières armes sur les champs de bataille italiens) et des réactions face aux atrocités de la guerre civile, permettrait peut-être tout à la fois d’inscrire la barbarie dans le présent des conflits, de permettre un nouveau discours pacifiste, de confier paradoxalement au souverain comme instance laïque, au-dessus des choix religieux personnels, le rôle d’arbitre et de régulateur des guerres (cf. les politiques), et, enfin, de relancer la question du jus in bello (le jus ad bellum n’étant plus vraiment opératoire, pas plus que le rôle d’arbitre du pape qui s’effondrera bientôt définitivement dans l’Europe née du traité de Westphalie). (shrink)