Collected works predominantly on Buddhist doctrines and philosophy.

TGFβ signaling plays a central role in regulating a broad range of cellular responses in a variety of organisms. TGFβ signaling from the cell membrane to the nucleus is mediated by the Smad family of proteins. During the past five years of intense investigation, key events in TGFβ signaling have been documented at the molecular and cellular level. Recent structural studies have improved our understanding of how specificity is generated in the TGFβ signaling pathways. Despite this progress, significant questions (...) remain regarding the precise mechanisms of signaling and point to the urgent need for well-controlled biochemical studies. Rather than giving a comprehensive review on Smad-mediated TGFβ signaling, this review focuses on functional insights provided by recent structural studies and discusses several existing controversies. BioEssays 23:223–232, 2001. © 2001 John Wiley & Sons, Inc. (shrink)

The identification of Smad proteins as molecular components of the transforming growth factor-β (TGF-β) signaling cascade has enhanced our understanding of how ligand-mediated activation of TGF-β receptors leads to modulation of target gene transcription. Recent studies have identified a distinct, structurally related class of Smads which inhibits, rather than transduces, TGF-β family signals. The molecular mechanism of action and the exact signaling pathways that are targeted by antagonistic Smads are not completely understood. These proteins appear to participate in autoregulatory (...) negative feedback loops in which signaling initiated by specific TGF-β family ligands induces the expression of an inhibitory Smad that then functions to modulate the amplitude or duration of signaling. Negative feedback circuits such as these play important roles in fine-tuning the activity of multifunctional signaling molecules during embryonic patterning and in response to pathologic stimuli in adults. BioEssays 21:382–390, 1999. © 1999 John Wiley & Sons, Inc. (shrink)

Although many regulators of skeletogenesis have been functionally characterized, one current challenge is to integrate this information into regulatory networks. Here, we discuss how the canonical Wnt and Smad‐dependent BMP pathways interact together and play antagonistic or cooperative roles at different steps of osteogenesis, in the context of the developing vertebrate embryo. Early on, BMP signaling specifies multipotent mesenchymal cells into osteochondroprogenitors. In turn, the function of Wnt signaling is to drive these osteochondroprogenitors towards an osteoblastic fate. Subsequently, both (...) pathways promote osteoblast differentiation, albeit with notable mechanistic differences. In osteocytes, the ultimate stage of osteogenic differentiation, the Wnt and BMP pathways exert opposite effects on the control of bone resorption by osteoclasts. We describe how the dynamic molecular wiring of the canonical Wnt and Smad‐dependent BMP signaling into the skeletal cell genetic programme is critical for the generation of bone‐specific cell types during development. (shrink)

Erdem, ahlaki değerlere uygun olarak yaşamayı ve hareket etmeyi ifade eden, doğru ve etik davranışları içeren bir kavramdır. Erdem eğilimleri, bireyin kişisel gelişimini desteklerken aynı zamanda toplumda barışı sağlaması, toplumsal uyumun, güven ve refahın sürdürülmesine katkıda bulunması bakımından önemlidir. Bu makalenin amacı, ilahiyat eğitimi ile erdem eğilimleri arasındaki ilişkiyi ortaya koymak; cinsiyet, akademik başarı algısı, hayatının çoğunu geçirdiği yerleşim yeri ve mezun olunan lise türü değişkenleri açısından ilahiyat fakültesi öğrencilerinin erdem eğilimleri arasındaki ilişkinin önemli olup-olmadığını nicel olarak araştırmaktır. Araştırmanın evrenini, (...) 2023-2024 eğitim-öğretim yılında Bayburt Üniversitesi İlahiyat Fakültesinde öğrenim gören 1270 öğrenci oluşturmuştur. Araştırmaya evreni oluşturan öğrencilerden tesadüfi örnekleme yöntemiyle belirlenen 240 ilahiyat fakültesi öğrencisi katılmıştır. Araştırmanın verileri, araştırmacı tarafından geliştirilen Bireysel Bilgi Anketi ile İbrahim Demirci ve Halil Ekşi tarafından geliştirilmiş olan Kişisel Erdemler Ölçeği ile 2024 Mart ayında yüz yüze toplanmıştır. Verilerin istatistiksel işlemleri ise SPSS programı kullanılarak yapılmıştır. Yapılan analizler neticesinde, cinsiyet, akademik başarı algısı ve hayatının çoğunu geçirdiği yerleşim yeri değişkenleri açısından ilahiyat fakültesi öğrencilerinin erdem eğilimleri arasında önemli bir ilişki olduğu ortaya çıkmasına karşılık; mezun olunan lise türü açısından önemli bir ilişki olmadığı sonucuna varılmıştır. İlahiyat literatüründe teorik olarak inceleme konusu yapılan “Erdem” kavramı ile ilgili, nicel yöntemler ile daha önce yapılmış herhangi bir araştırma yoktur. Alana orijinal katkısı bakımından bu makale, İlahiyat literatüründe Din Eğitimi Bilimi yaklaşımıyla “Erdem” kavramının nicel yöntem ile incelendiği yayınlanmış ilk çalışmadır. (shrink)

İbn Sînâ, Yeter Sebep İlkesi’ni (YSİ), yani her şeyin bir sebebi olduğu ve sebepsiz hiçbir varlığın var olamayacağı iddiasını savunan modern dönem öncesi filozoflarından biridir. YSİ’nin sonuçlarından biri de zorunlulukçuluktur (necessitarianism); yani gerçekte var olan her şeyin aynı zamanda zorunlu olarak var olduğu iddiasıdır. Bu fikre göre sebepler zincirinin her bir üyesi kendinden önceki sebepler tarafından belirlenir. Dolayısıyla YSİ, olayların başka türlü de olabileceğini telkin eden insan sezgisine karşı çıkmaktadır. Bu çalışmadaki amacım, İbn Sînâ sonrası yazarların insan iradesini dışlamak suretiyle (...) YSİ’nin zorunlulukçu sonuçlarını hafifletmeye çalışıp çalışmadıklarını araştırmaktır. Nasîrüddin Tûsî’nin (ö. 672/1274) Cebr ve Kader adlı Farsça risalesi ile Tecrîdü’l-i‘tikâd adlı kelâm kitabı arasında bir karşılaştırma yapmaya odaklanacağım. Bu konuyu seçmemin öncelikli sebebi, insanların eylemlerinin bağımsız fâilleri olduklarını sezgisel olarak bildiklerine dair Tûsî’nin iddialarıdır ki bu, YSİ‘nin evrensel uygulanabilirliği ile çelişiyor gibi görünmektedir. Tûsî’nin özgür irade konusunda, metinlerin karakterine ve yazıldıkları döneme bağlı olarak, bazen İbn Sînâ ile tutarlılık arzeden bazen de Mu‘tezile’ye angaje olan farklı görüşler benimsediğini savunacağım. Tûsî’nin, bazen nedensel olarak etkin olmamasına rağmen insan özgürlüğüne nasıl yer bıraktığını göstereceğim. O, insan özgürlüğünü, insanın karşı karşıya kaldığı fiziksel veya ilahî diğer belirlenim türlerinden bağımsız olarak hareket edebilen farklı bir belirlenim türü olarak anlar. Genel olarak bu mesele, Tûsî’nin İbn Sînâ felsefesine ya da Şiî kelâmına bağlılığını test etmekte ve hatta onu bazı eserlerinde İbn Sînâ’nın bilgi görüşüne karşı bir duruş sergilemeye zorlamaktadır. (shrink)

Bu çalışma, Suyûtî’nin el-İtkân fî ulûmi’l-Kur’ân isimli kitabının birinci türüyle ilgili bir incelemedir. Bu başlık nüzul zamanı ve mekânı ile ilgili Kur’ân ayetlerinin taksimi konusunda söylenen sözlerin tahlilini içermektedir. Ebu’l-Kâsım el-Hasan b. Muhammed en-Nisabûrî bu türleri et-Tenbîh 'alâ fadl-i ulûmi’l-Kur’ân isimli kitabında 25 türe ayırmıştır. Bu türlerin, Kur’ân ilimlerinin en üstünü ve tefsir ilmine başlamak için şart olduğunu ifade etmiştir. Suyûtî, İtkânı’nda bu türlerin çoğunu müstakil başlıklar altında ele alarak bu görüşe katılmıştır. Bu durum bazı âlimlerin çekingen kaldığı diğer bazılarının (...) abartı ve aşırılık olarak nitelediği, bir kısmının da şüpheye kapı araladığını belirttikleri bir husustur. Bu şüphelerin en önemlilerinden birisi de Kur’ân’ın tarihselliği söylemidir. Zira Mekkî ve Medenî konusunda aktarılanlar, pek çok müsteşrik ve modernistin Kur’ân’ın bütün zaman ve mekânlar için geçerli olmasını reddetmelerinde onların imdadına yetişmiştir. İşte bu araştırma konuyla ilgili en önemli görüş ve söylemlerin problemlerini gidererek çözüm yollarını ortaya koyan bir analiz ve tartışmadır. Ayrıca bu araştırma şüphe yollarının kapatılmasına katkı sağlayacak, Mekkî ve Medenî konusunda geniş bir bakışı açısı sunacaktır. (shrink)

İslam ve demokrasi arasında bir çatışma ya da uyum olduğuna ilişkin tartışmaların oldukça uzun bir geçmişi bulunmaktadır. Konu gerek İslam dünyasından gerekse İslam dışı dünyadan çok sayıda düşünürün ve araştır-macının ilgisini çekmekte ve araştırmalarına yön vermektedir. Tunus’ta bir siyasi ve dinî hareket olan Nahda’nın kurucusu ve lideri Raşid Gannuşi de İslam ve demokrasi tartışmalarına aktivist ve entelektüel olarak yoğun bir katkı sunmuş ve halen sunmaya devam etmektedir. Onun gerek teorik gerekse pratik alanda gösterdiği çabalar İslam ve demokrasinin birlikte var olabileceğini, (...) dahası İslamî bir demokrasinin mümkün olduğunu kanıtlamaya dönük olarak karşımıza çıkmaktadır. Gannuşi İslamî demokrasi kavramına olan bağlılığıyla tanınmaktadır. Bu çalışma, Gannuşi’nin konuyla ilgili yaklaşımını anlamaya çalışmak ve onun İslam ve demokrasinin birbiriyle uyumlu olduğuna ilişkin argümanlarını analiz etmek amacındadır. Çalışma aynı zamanda, İslam ve demokrasinin çatışmadığı yönündeki tezi hangi gerekçeler ve nasıl bir motivasyonla desteklediğini anlama teşebbüsü içindedir. Konu farklı yönlerden ele alındıktan sonra yazar sonuç bölümünde kendi değerlendirmesini sunmaktadır. (shrink)

Bu çalışma, DKAB öğretmenlerinin pedagojik inançlarını çeşitli değişkenler açısından inceleme amacını taşımaktadır. Pedagojik inanç, öğrenme-öğretme süreçlerine yönelik geliştirilen değer örüntüleridir. Pedagojik inançlar, öğretimin merkezi figürlerinden olan öğretmenlerin iki temel değer örüntülerinden birisidir ve bu sebeple nitelikli bir öğrenme-öğretme ortamı için dikkate alınmalıdır. Çalışma karma desenli bir çalışmadır ve nicel araştırmada model olarak değişkenler arasındaki ilişkiyi ele alan tarama modellerinden olan ilişkisel tarama modeli kullanılmıştır. Veriler, doküman analizi ve tarama yöntemiyle toplanmıştır. Nitel çalışma içinse durum çalışması yöntemi kullanılmıştır. Tarama verilerine göre (...) DKAB öğretmenlerinin pedagojik inançları ile cinsiyet, eğitim durumu, görev yaptıkları okul türü ve kitap okuma alışkanlıkları arasında anlamlı bir ilişki tespit edilmemiştir. Görev süresi ile pedagojik inanç arasında ise anlamlı bir ilişki görülmüştür. Söz konusu tarama verilerinin öznel olarak nasıl anlamlandırıldığını keşfetmek için on öğretmenle mülakat yapılmıştır. Öğretmenlere göre genel olarak DKAB dersi çıktıları yeterli değildir ve bu yetersizliğin en önemli sebepleri olarak sistem ve öğrenci dile getirilmiştir. Katılımcıların ideal DKAB öğretmeni için dile getirdiği nitelikler ise iletişim, alan bilgisi, meslek bilgisi, merhamet, teknolojik araçları kullanmak ve kendini yenilemektir. Katılımcılar için pedagojik inançlardan daha çok gerçek öğrenme-öğretme ortamlarının özellikleri daha önemli görünmektedir ya da daha doğru ifadeyle realist öğretmen kimliği geliştirdikleri söylenebilir. (shrink)

Autophagy and YAP1‐WWTR1/TAZ signalling are tightly linked in a complex control system of forward and feedback pathways which determine different cellular outcomes in differing cell types at different time‐points after perturbations. Here we extend our previous experimental and modelling approaches to consider two possibilities. First, we have performed additional mathematical modelling to explore how the autophagy‐YAP1 crosstalk may be controlled by posttranslational modifications of components of the pathways. Second, since analogous contrasting results have also been reported for autophagy as a (...) regulator of other transduction pathways engaged in tumorigenesis (Wnt/β‐catenin, TGF‐β/Smads, NF‐kB or XIAP/cIAPs), we have considered if such discrepancies may be explicable through situations involving competing pathways and feedback loops in different cell types, analogous to the autophagy‐YAP/TAZ situation. Since distinct posttranslational modifications dominate those pathways in distinct cells, these need to be understood to enable appropriate cell type‐specific therapeutic strategies for cancers and other diseases. (shrink)

This review explores the hypothesis that regulation of nucleocytoplasmic shuttling is a means of driving differentiation, using spermatogenesis as a model. The transition from undifferentiated spermatogonial stem cell to terminally differentiated spermatozoon is, at its most basic, a change in the repertoire of expressed genes. To effect this, the complement of nuclear proteins, such as transcription factors and chromatin remodelling components must change. Current knowledge of the nuclear proteins and nucleocytoplasmic transport machinery relevant to spermatogenesis is consolidated in this review, (...) and their functional linkages are highlighted not only as a means of regulating nuclear protein composition, but also as a key mechanism regulating gene transcription and hence cell fate. Through this, we hypothesize that male germ cell differentiation is mediated through regulation of nuclear transport machinery components, and thereby of the access of critical factors to the nucleus. The importance of nucleocytoplasmic trafficking to male germ cell differentiation is discussed, using the sex-determining factors Sry and SOX9, cell cycle regulators, CREM and cofactors and the Smads as specific examples, together with the roles in gametogenesis for particular nuclear transport factors in Caenorhabditis elegans and Drosophila. BioEssays 27:1011–1025, 2005. © 2005 Wiley Periodicals, Inc. (shrink)

Members of the transforming growth factor beta (TGFβ) family are pleiotropic cytokines with key roles in tissue morphogenesis and growth. TGFβ1, TGFβ2 and TGFβ3 are abundant in mammalian reproductive tissues, where development and cyclic remodelling continue in post‐natal and adult life. Potential roles for TGFβ have been identified in gonad and secondary sex organ development, spermatogenesis and ovarian function, immunoregulation of pregnancy, embryo implantation and placental development. However, better tools must now be employed to map more precisely essential functions and (...) the regulatory networks governing their activity. Gene ablation and transgenic models are expected to provide novel insights into distinct physiological activities for each TGFβ isoform in normal reproductive function and reproductive pathologies. It is also necessary to consider the mechanisms controlling TGFβ activation from latent precursor forms, and receptor and binding protein expression. Smad intracellular signalling circuitry and modulation by environmental stimuli through cross‐talk with other signal transduction pathways will further constrain TGFβ action. This review examines existing evidence for TGFβ1, TGFβ2 and TGFβ3 regulation of male and female reproductive biology, and highlights prospects for future research. BioEssays 24:904–914, 2002. © 2002 Wiley Periodicals, Inc. (shrink)

Russell-Meinong tartışması, geçtiğimiz yüzyılın başlarında gerçekleşmiş, nesne sorununu konu eden bir tartışmadır. Tartışmanın odak noktaları; varlığın nasıl anlaşılması gerektiği, nelerin var olduğu, nesne olma koşulları ve bu bağlamda ontoloji-mantık ilişkisidir. Farklı ilkeler ve yöntemler benimseyen iki düşünür, bazı konularda uzlaşı içinde olmakla birlikte çeşitli konularda görüş ayrılıkları içindedir. Russell, temel olarak, varlık-dışı nesneleri içeren önermelerin çelişmezlik ve 3.halin olanaksızlığı ilkelerini çiğnediğini öne sürerek bu nesnelerin ontolojiden elenmesini savunmaktadır. Meinong’un nesne kuramı, özetle, varlık tarzlarını ayırmakta ve mantık ilkelerinin belirleyiciliğini sınırlandırmaktadır. Bu (...) düşüncelere cevap verme arayışı, Russell'ın betimlemeler kuramını ortaya koymasını sağlamıştır. Betimlemeler kuramının getirdiği çözümler ve kuramın yalınlığı, yıllar boyunca bu tartışmada haklı olanın Russell olduğunun düşünülmesine neden olmuştur. Ancak metafizik ve mantıktaki çeşitli gelişmeler ile tartışma yeniden ele alınmıştır. Bu yeniden ele alma sayesinde tartışmaya ilişkin yeni yorumların ileri sürülmesinin olanağı ortaya konmuştur. Buna bağlı olarak çeşitli çağdaş metafizik kuramların ortaya çıkması söz konusu olmuştur. Bu çalışmada öncelikle Russell’ın tartışmanın gerçekleştiği dönemdeki düşünceleri serimlenecek ve Meinong’a getirdiği eleştiriler ortaya konacaktır. Daha sonra Meinong’un nesneler kuramı kapsamlı şekilde sergilenecektir. Böylece, iki düşünürün düşünceleri karşılaştırılmaya tabi tutularak aralarındaki görüş benzerlikleri ve farklılıkları saptanacaktır. Bu çerçevede, tartışmaya ilişkin bir değerlendirme sunularak tartışmanın yeniden ele alınmasının nedenleri, tartışmaya dair öne sürülen çeşitli yorumlar ve tartışmanın güncel metafizikteki yansımaları açıklanacaktır. (shrink)

Ahlak ve ahlaki değerler insanın varoluşuyla başlayan bir olgudur. Ahlak, insanın yaşamını devam ettirmesi için gereklidir. Ahlâki değerlerden uzak bir ferd düşünülemeyeceği gibi, milletler ve toplumlar da düşünülemez. Ahlâkî değerler insanları ister istemez kuşatır ve yaşamın idamesini sağlar. İnsan varlığının yaşam koşullarını bu denli etkileyen bir olguyu tez konusu seçmemdeki amacı, özelde Stoa Ahlakı’nı, genelde ise ahlak felsefesini araştırmak ve ahlak olgusunu anlaşılmasına katkıda bulunmaktır. Stoa Okulu milattan önce üç yüzlü yıllarda Kıbrıslı Zenon’un (335-264) öncülüğünden kurulmuştur. Kıbrıslı Zenon insan için (...) en önemli olanın ahlak olduğunu ve ahlak felsefesi (etik) yapmanın felsefenin en temel sorunu olduğunu vurguluyordu. Ahlak felsefesi dışındaki diğer bilimler ahlak felsefesi (etik) yapmak için gereklidir. Zenon’dan sonra gelen filozoflar da aynı çizgiyi takip etmişlerdir. Onun bu felsefi düşüncesi Stoa Okulu’nun son filozofu olan Roma İmparatoru Marcus Aurelius Antoninus’a (121-180) kadar sürdü. Ahlâkın üzerinde bu denli çok durmuş olan bu felsefî anlayışın ahlâkının ne olduğunu anlamak için, dikkate alınması gerektiğini düşünmekteyim. İnceleme konum olan “Stoa Okulu’nda Felsefe ve Ahlak” yukarıda belirttiğim hususa değinen bir çalışmadır. Bu çalışmamın ilk bölümünde Stoa Okulu’nun tarihi gelişimini, temel görüşlerini ve diğer felsefî akımlarla etkileşimini anlattım. Bunu yapmamdaki amacım, Stoa’nın ahlâk anlayışını açıklamaya bir ön hazırlık teşkil etmesiydi. İkinci bölümde ahlak felsefesi ve ahlâk felsefesi yönünden Stoa’yı etkileyen filozoflara değindim. Üçüncü bölümde ise, bütün bunlardan faydalanarak Stoa ahlâkı üzerinde durdum. Son bölümde, fatalizm- kadercilik kavramları çerçevesinde, Stoa fatalizmine ve İslam kaderciliğine değindim. Bu bölüm özellikle Fatalizm ve kadercilik kavramlarının karıştırılması ve birbirinin yerine kullanılması açısından önemliydi. Buna elimden geldiği kadar açıklık getirmeye çalıştım. (shrink)

Ubiquitination of protein species in regulating signal transduction pathways is universally accepted as of fundamental importance for normal development, and defects in this process have been implicated in the progression of many human diseases. One pathway that has received much attention in this context is transforming growth factor‐beta (TGF‐β) signalling, particularly during the regulation of epithelial‐mesenchymal transition (EMT) and tumour progression. While E3‐ubiquitin ligases offer themselves as potential therapeutic targets, much remains to be unveiled regarding mechanisms that culminate in their (...) regulation. With this in mind, the focus of this review highlights the regulation of the ubiquitination pathway and the significance of a recently described group of NEDD4 E3‐ubiquitin ligase isoforms in the context of TGF‐β pathway regulation. Moreover, we now broaden these observations to incorporate a growing number of protein isoforms within the ubiquitin ligase superfamily as a whole, and discuss their relevance in defining a new ‘iso‐ubiquitinome’. (shrink)